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宏病毒组学

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宏病毒组学(Viral Metagenomics)是宏基因组学的一个分支,是在宏基因组学概念的基础上,结合病毒自身的特点,如应用特殊方法把特定环境中所有病毒与其他微生物分开,然后提取的病毒核酸,用高通量技术进行病毒核酸测序(VLP metagenomes),也可以不进行病毒与微生物分离并提取核酸进行测序(Bulk metagenomes),最后将测序结果与现有的核酸文库进行比对,并运用软件分析处理后最终得到研究样品中病毒群落的组成信息。

 

技术路线

技术参数

样本要求

粪便 3-5 g/sample

DNA 总量≥1 μg,浓度≥100 ng/μL

 

检测平台

测序平台:Illumina Nova Seq 6000

测序方法:PE150

测序深度:5G/20G

 

常规项目周期

实验检测:60个自然日(从收到客户预付款并质检合格之日起)

数据分析:10个自然日

 

应用方向

噬菌体治疗

敏化抗生素抗性细菌

促发机体免疫从而保护宿主免受病毒感染等

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宏病毒组学