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PRM靶向蛋白质组学

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平行反应监测(parallel Reaction Monitoring, PRM) 是一种基于Orbitrap为代表的高分辨、高精度质谱的离子监视技术,首先利用四级杆质量分析器的选择能力,用Q1选择目标肽段的母离子,随后在collision cell 中对母离子进行碎裂, 最后利用Orbitrap分析器在二级质谱中检测所选择的母离子窗口内的所有碎片信息。这样能够对目标蛋白质、目标肽段(如发生翻译后修饰的肽段)进行选择性检测,即可对目标蛋白质/肽段进行相对(绝对)定量。从而实现对复杂样本中的目标蛋白质/肽段进行准确地特异性分析。
 
产品分类:
a.相对定量 (目的同WB)
b.绝对定量 (目的同Elisa)
 
技术优势:
(1)无需抗体,可直接对样本中目标蛋白质进行定量分析
(2)高特异性、准确度和灵敏度,靶向检测目标蛋白对应的多个unique肽段
(3)通量高,可以同时实现几十个蛋白的定量检测。
 
技术流程:
 
蛋白质组学
 
技术参数
样本要求:
动物及临床组织标本 100 mg/sample
血清、血浆      200 μL/sample
细胞 、微生物    1×107 cells/sample
 
检测平台:
 
蛋白质组学
 
应用方向: 
验证修饰和非修饰定量蛋白组学结果;
目标蛋白相对定量和绝对定量分析。
 
案例分享:
Identification of a Blood-Based Protein Biomarker Panel for Lung Cancer Detection
肺癌是世界上最致命的癌症,主要是由于它在诊断时处于晚期。非侵入性的早期检测方法仍然是提高患者生存率的必要手段。本文采用液相色谱-平行反应监测(LC-PRM)质谱法测定128例肺癌患者和93例健康献血者血浆中351种蛋白质的水平,通过生信分析寻找最佳蛋白组合用于预测。确定了血浆中6个蛋白组作为肺癌的潜在诊断工具,并在48名患者和49名健康志愿者中得到验证。作为高风险和中等风险人群的常规检查,它可以补充目前在肺癌筛查中采用的技术。
 
蛋白质组学
6种蛋白生物标志物的血浆水平作为肺癌诊断指标
 
部分应用文献:
[1]El-Khoury V , Schritz A , Kim S Y , et al. Identification of a Blood-Based Protein Biomarker Panel for Lung Cancer Detection[J]. Cancers, 2020, 12(6):1629.
[2] Han B,  Ma X,  Cui D, et al. Parallel reaction monitoring revealed tolerance to drought proteins in weedy rice (Oryza sativa f. spontanea) [J]. Sci Rep ,2020 Jul 31;10(1).
[3]  Miao W,  Yuan J,  Li L, et al. Parallel-Reaction-Monitoring-Based
Proteome-Wide Profiling of Differential Kinase Protein Expression during Prostate Cancer Metastasis in Vitro[J]. Anal. Chem, 2019 08 06;91(15).
[4] Bonnet M,  Soulat J,  Bons J, et al. Quantification of biomarkers for beef meat qualities using a combination of Parallel Reaction Monitoring- and antibody-based proteomics[J]. Food Chem, 2020 Jul 01;317.
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