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干货连载 | 三分钟学会SIMCA判别分类模型——PCA-Class

分类:
阿趣动态
发布时间:
2021/01/22 16:52
浏览量
 
上期为大家介绍了SIMCA16 OPLS操作教程,本期将为大家介绍SIMCA判别分类模型(PCA-Class)操作教程~
  
1
原始数据
 
通过判别分析来找组别之间的较佳判别变量,并结合分析来自不同数据组(训练集与测试集)的数据。
 
小提示:在数据整理时就要将训练集与测试集分开,这点很重要哟,关系着是否能成功建立PCA-Class模型。
 
代谢组学
 
2
数据导入
 
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3
自动拟合
 
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4
添加主成分
 
代谢组学
 
5
创建分组模型的DModX图表
 
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6
更改横坐标名称
 
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7
更改颜色
 
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此时DModX图表是内部验证,数据是训练集40的个样本。红线为95%置信区间,图中F组超过置信区间说明两组样本区分较大,不是同组样本。
 
代谢组学
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同理,在模型二中,F组都处于置信区间95%以内,属于同组样本。C组全部样本都超过置信区间95%的红线以上,与F组不是同组样本。
 
8
预测集数据验证模型
 
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此时DModX图表是外部验证,数据是测试集的10个样本。红线为95%置信区间,图中C组中有一个样本超过置信区间,说明该样本不属于C组样本。
 
代谢组学
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同理,在模型二中,10个样本正确分类。总的来说,外部验证的DModXPS+图得出,模型一将10个样本中的9个正确分类,而模型二将10个样本中的10个正确分类。
 
在这种情况下,另一个有用的工具是“Coomans’  plot”。该图是通过在同一散点图中共同绘制两个模型的DModXPS+值而创建的。
 
代谢组学
 
我们讨论的最后一个图——ROC图。它绘制了真实预测率与错误预测率的关系。
 
代谢组学
 
我们可以从上面的两个ROC图中看到,模型二有完美的外部验证性能,而模型一的性能稍差。
 
今天小编关于PCA-Class绘制教程就到这了,大家有木有都会使用了呢。SIMCA软件操作简单灵活,是目前全球较受科研工作者欢迎的多元变量统计分析软件,并已经成为多元变量统计分析的标杆。感兴趣和有需求的老师立马行动起来吧!
 
暖心的小编会持续为大家推出SIMCA16分析操作干货哦,大家尽请期待!
 
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