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新品发布 | 年度重磅升级——发现代谢组学HD

分类:
阿趣动态
发布时间:
2021/11/17 17:16
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还记得小趣前不久发送的新仪器密报吗?按照约定的时间,噔噔蹬蹬~发现代谢组学HD系列新产品如期上线啦!

「发现代谢组学」系列产品致力于用体系的力量解决无限的需求(新品发布 | “发现代谢组学”——用体系的力量解决无限的需求)而「发现代谢组学HD」作为「发现代谢组学」的升级产品,凭借仪器性能的提升和数据库的升级,能够大幅提升代谢物的检测数量和准确性

 

发现代谢组学HD实测结果

代谢物「多」且「准」

  • 物质检出数量翻倍

我们针对亲水和MIX两大体系完成了升级,随机对血清、尿液、动物组织、植物组织等多种样本类型进行了实测。

升级后的「发现代谢组学HD-亲水版」,物质检出数量平均为升级前的241%,物质定性数量为139%。以人血清样本为例,物质检出数量平均提升了96%,物质定性数量平均提升了29%

升级后的「发现代谢组学HD-MIX版」,物质检出数量平均为升级前的193%,物质定性数量为134%。以小鼠血清样本为例,物质检出数量平均提升57%,物质定性数量平均提升75%

  • B(i)级别可靠鉴定代谢物20%

配合最新优化升级的数据库,参考2021年最新NATURE METHODS(IF=28.547)[1]对代谢物的鉴定级别进行了注释,「发现代谢组学HD」系列产品各种类型样本B(i)级别鉴定代谢物平均占比可达到20%。基于非靶向技术的核心优势,随着数据库的迭代升级,可以对已检出的数据进行反复挖掘,对未知物进行更深度的注释及提高物质鉴定的可靠性。

(P.S.BIOTREE对「发现代谢组学HD」系列产品提供免费数据再次挖掘服务)

 

发现代谢组学HD两大升级​

1. 仪器性能的提升

使用Thermo Orbitrap Exploris 120高分辨质谱仪器平台,在性能和质量精度方面都有很大提升,从而采集到更多的代谢物信号。

 

2.数据库的升级

为了充分利用代谢组学数据,我们需要在不同的实验室之间进行可比性。考虑到不同技术手段产出的数据存在差异,在发表的论文中,需要标明物质注释的相关信息,其中代谢物注释的可靠等级尤为重要,BIOTREE对数据库进行了全面的升级提供了代谢物注释的分类等级,「发现代谢组学HD」系列产品可以提供达到B(i)级别的代谢物鉴定。

参考上文提到的NATURE METHODS建议,代谢物鉴定级别:

A 标准品靶向验证或NMR鉴定

B(i) 基于标品数据库MS/MS 的可靠匹配

B(ii) 基于模拟数据库 MS/MS 的可靠匹配

B(iii) 基于MS/MS 的部分匹配

C(i ) 基于标品数据库MSn 的可靠匹配

C(ii) 基于模拟数据库 MSn 的可靠匹配

C(iii) 基于 MSn 的部分匹配

D 基于MS的匹配

 

参考文献

[1] Alseekh S, Aharoni A, Brotman Y, et al. Mass spectrometry-based metabolomics: a guide for annotation, quantification and best reporting practices. Nat Methods. 2021 Jul;18(7):747-756. doi: 10.1038/s41592-021-01197-1. Epub 2021 Jul 8. PMID: 34239102.

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