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产品升级 | 植物MRM阿趣广靶®代谢组学产品分析升级

分类:
阿趣动态
发布时间:
2022/02/23 13:15
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植物MRM阿趣广靶®代谢组学,作为一种新型代谢组检测技术,具有高通量、高灵敏、广覆盖的技术优势,可以同时准确定性、定量检测近千种初生和次生代谢物,为解析代谢通路和生物学机理研究提供了重要基础。良将配宝剑,优良的检测技术也需全面的数据分析加持,方可利剑出鞘,于微末之处见章程。此次植物广靶代谢组学产品进行了分析升级,新版本分析报告具有7大新增,5大亮点优化,分析内容增至20+项,多角度挖掘数据可用信息,分析丰富度在行业内遥遥领先。为了让广大科研人能拿到易读易看易懂的报告,得到更满意的结果。我们针对报告整体排版风格,数据表格展示形式,图片数量和质量,图表注释,分析角度和参考文献等方面进行了全面系统的升级优化。

自2月14日起交付的植物MRM阿趣广靶®代谢组学项目,即可享受全新版本分析结果!

7

1. 新增聚类分析(HCA) 

HCA图

HCA图从总体层次揭示样本代谢物的表达情况,一眼便可以看出此次检测出代谢物的整体表达情况。

 

2. 新增Z-score分析 

Z-Score图

Z-score图是在通过计算Z值来对不同样本种的差异代谢物做归一化处理,横坐标表示Z值,纵坐标表示差异代谢物,不同颜色的点表示不同组别的样本,可以非常直观的看到每个差异代谢物在不同组间的分布情况。

 

3. 新增Box-plot分析  

Box-plot图

Box-plot分析箱形图(Box-plot)是一种用作显示不同组数据分散情况资料的统计图。可以很方便进行多组数据分布特征的比较,同时直观展示一些异常值的分布情况。

 

4. 新增韦恩分析 

韦恩图

韦恩图每一个椭圆代表一组分析对比,并用不同的颜色进行映射,交集和非交集个数分别用数字进行统计显示韦恩图常用于发现多组间差异代谢物。

 

5. 新增 K-Means分析 

K-Means图

K-Means图将所有分组筛选得到全部差异代谢物的相对含量进行聚类分析,直观清晰的展示代谢物在不同分组中的相对含量变化趋势。

 

6. 新增KEGG富集分析 

 

KEGG分类图

KEGG分类图,横坐标表示某一条通路下注释到的代谢物数量占所有注释到的代谢物数量的百分比,纵坐标表示富集到的KEGG代谢通路ID号。对于注释到的通路进行整体分类展示,易于从整体把握差异代谢物参与代谢通路类型。

KEGG富集图

KEGG富集图,横坐标表示每个通路对应的Rich Factor,纵坐标为KEGG代谢通路ID号。圆点的大小表示该通路中富集到的差异代谢物数量。该图展示出差异代谢物所注释通路的富集程度,为挑选关注通路时提供数据支撑。

差异丰度得分图

差异丰度得分(Differential Abundance Score,DA Score)是指某一通路上注释到的上调差异代谢物数量与下调差异代谢物数量之差与该通路上的所有代谢物数量的比值,其作用是可以反映出某一通路中所有差异代谢物的总体变化。

 

7. 新增ROC曲线

ROC曲线图

ROC曲线(receiver operating characteristic curve)是一种常用来筛选评估生物标记物的分析方法。AUC(Area under the curve)是衡量ROC曲线非常有用的度量。AUC始终在0.5(两个类在统计上相同)和1.0(有一个阈值可以实现类之间的完美分离)之间,越接近1,物质的在对照组和实验组的分离就越明显(即为潜在的生物标记物)。

1. 分析内容逻辑优化

重新梳理分析报告逻辑和节点名称,新版本报告逻辑为数据预处理→基础数据分析→高级数据分析。在每个分析节点丰富分析层次,增加数据分析角度,有助于老师多维数据利用。

 

2. 页面内容优化

页面整体更为简洁,段落间距更加合理,整体排版按照论文格式进行调整,观看报告体验更佳,符合科研人员习惯。此外,语言描述同样优化, 信息描述删繁就简,内容更加详实,让大家更加易懂易掌握。

 

3. 表格注释展示优化

新版本报告表格改为三线表格,整体表现形式简洁,功能更加分明,注释信息全面合理,利于老师理解内容。

 

4. 分析效果图优化

优化OPLS-DA置换检验图,新版本置换检验图更加适宜在学术文章中展示。优化差异代谢物相关性热图,将相关系数数值直接展示,便于文章书写过程中的数据引用。

OPLS-DA置换检验图

相关性热图

 

5. 补充分析软件列表及版本

详细的分析软件列表及版本,让所有的分析都有迹可循,为后续老师写文章提供理论依据。


 

喜迎开学季,为了更好的助力各位老师们在科研道路上披荆斩棘,同时也为了让老师们更轻松的体验到植物MRM阿趣广靶升级后的全新面貌。

植物MRM阿趣广靶®限时开放免费预实验活动,活动详情请与当地销售工程师具体沟通。

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