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DIA定量蛋白质组学研究
产品简介产品简介

数据非依赖型的扫描模式(Data-independent acquision,DIA)是近几年来发展的一种新的质谱数据采集方式。它是对传统shotgun分析(采用DDA模式,Data Dependent Analysis)的一种改进技术,能够对复杂样品中的所有信号进行无偏向性的MS分析,从而获得更高的肽段覆盖率。DIA扫描模式将质谱整个全扫描范围分为若干个窗口,高速、循环地对每个窗口中的所有离子进行选择、碎裂、检测,从而无遗漏、无差异地获得样本中所有离子的全部碎片信息。

数据非依赖性采集的信号处理方法

产品简介DIA技术流程


DIA实验流程

产品简介DIA项目流程


DIA技术流程

技术参数

产品类型

DIA定量蛋白组

仪器平台

Orbitrap 系列(Q Exactive HFX, Thermo/Orbitrap Exploris 240, Thermo 等)

搜库软件

Spectronaut/PEAKS

样本要求

动物组织标本 100 mg/sample
血清、血浆 200 μL/sample
细胞、微生物 1×107 cells/sample
植物嫩叶、嫩芽 200mg/sample
植物种子、果实 500mg/sample

液氮或-80°C保存

足量干冰运输,避免反复冻融

技术优势技术优势(数据非依赖性采集优势)

1、采集所有离子及碎片图谱,重现性好

2、基于碎片离子定量,选择性好,可媲美SRM/MRM

3、循环时间固定,扫描点数均匀,定量准确度高

4、高通量,能同时监测所有目标蛋白

医学案例分析医学方向—案例分析

Proteome profiling in cerebrospinal fluid reveals novel biomarkers of Alzheimer’s disease

期刊: Molecular Systems Biology
影响因子: 8.991
技术方法: DIA高通量蛋白组
研究内容

阿尔茨海默病(AD)是最常见的痴呆类型,其发病率在老龄化社会中快速增长,生物标志物已成为重要的诊断工具,以确定是否存在痴呆症发作前的记忆丧失。目前大多数研究集中在Ab和tau上,因为它们是淀粉样斑块和神经原纤维缠结的主要成分。本文作者应用DIA蛋白质组学技术深度分析脑脊液样本,寻找阿尔兹海默病的疾病的新型诊断标志物。

蛋白质与t-tau的相关性和注释项富集分析

农学案例分析农学方向—案例分析

Schizotetranychus oryzaeUnraveling Rice Tolerance Mechanisms Against Mite Infestation

期刊: Frontiers in Plant Science
影响因子: 4.402
技术方法: DIA高通量蛋白组
研究内容
大米是世界上一半以上人口的主食。稻曲叶螨(Acari:T etranychidae)的侵染给水稻生产造成巨大损失。为了寻找更能耐受稻瘟病的水稻基因型,作者对巴西境内的7个品种的形态和生产参数进行了评估,并通过对比反应鉴定了两个品种。在侵染期间,所有品种的叶片损伤相似。对叶片进行了DIA蛋白质组学分析,发现与植物防御有关的蛋白质(如茉莉酸合成)和与其他耐受机制(如氧化应激、光合作用和DNA结构维持)以及能量生产和一般代谢过程有关的蛋白质的变化。数据显示IRGA 423对稻裂叶螨具有耐受性,此发现可用于提高水稻抗螨性的生物技术研究。

IRGA水稻品种对稻曲叶螨侵染的耐受机制



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