产品简介数据非依赖型的扫描模式(Data-independent acquisition, DIA)是近几年来发展的一种新的质谱数据采集方式。能够对复杂样品中的所有信号进行无偏向性的MS分析，从而获得更高的肽段覆盖率。将质谱整个全扫描范围分为若干个窗口，高速、循环地对每个窗口中的所有离子进行选择、碎裂、检测，从而无遗漏、无差异地获得样本中所有离子的碎片信息。4D-DIA基于timsTOF Pro2质谱仪，在传统三维数据（保留时间、质荷比、离子强度）的基础上增加了第四个维度，离子淌度信息。4D-DIA利用diaPASEF技术能够全面提升蛋白质鉴定能力、检测灵敏度和数据完整性。
技术流程
技术参数▶ 产品类型
4D-Label free定量蛋白质组
▶ 仪器平台
timsTOF Pro2, Bruker
▶ 搜库软件
Spectronaut
▶ 样本要求
动物组织标本：50 mg/sample
血清、血浆： 100 μL/sample
细胞、微生物：1×107 cells/sample
植物嫩叶、嫩芽： 200 mg/sample
植物种子、果实：500 mg/sample
液氮或-80°C保存
足量干冰运输，避免反复冻融
应用领域
食品科学领域：提高食品安全，改善口感和营养程度的研究
畜牧业领域：提高肉类品质和饲养条件
病毒领域：新型病毒抑制因子挖掘研究
农业领域：农作物发育机制的研究
生物疾病分子机制研究
生物疾病标志物研究
药物作用靶点研究
药物作用机理研究
技术优势▶ 扫描速度快：
在整个LC-MS/MS流程中，每秒可以获得100-150张高分辨的MS/MS谱，且可保持40,000-50,000高的分辨率；尤其适用于临床大队列样本分析，周期快。
▶ 高准确性：
额外一维离子淌度提高了数据完整性，可以从复杂数据库实现化合物的高可信度匹配以及更低的错误发现率(FDRs)；
▶ 高灵敏度：
高扫描速度获得更高的灵敏度，可以使用更少的样品鉴定到更低丰度的蛋白；
▶ 高稳定性：
可以连续分析数千个样品，仪器保持稳定的性能。
医学方向—案例分析▶ High-resolution serum proteome trajectories in COVID-19 reveal patient-specific seroconversion
期刊： EMBO Molecular Medicine
影响因子： 14.26
技术方法： 4D-DIA定量蛋白质组学
▶ 研究内容
运用蛋白质组学寻找和发现有价值的生物标志物是目前临床研究中的重要热点之一。该研究应用4D-DIA定量蛋白质组学对COVID-19患者和PCR阴性对照组的血清蛋白图谱进行分析，发现与对照组相比，26％的蛋白质在疾病过程中发生了显著变化，其中先天免疫系统、凝血调节因子和脂质稳态相关蛋白存在显著变化，此外还发现了新的潜在生物标志物ITIH4，这些成果为深入了解新冠病毒感染调控蛋白以及疾病进展提供了重要参考信息。
▶ 研究结果
基于4D的血清蛋白质组学分析
农学方向—案例分析▶ Coral and it's symbionts responses to the typical global marine pollutant BaP by 4D-Proteomics approach
期刊： ENVIRONMENTAL POLLUTION
影响因子： 9.988
技术方法： 4D-DIA定量蛋白质组学
▶ 研究内容
造礁石珊瑚和虫黄藻之间的互利共生关系是珊瑚礁生态系统的关键支撑，然而这一共生关系正面临着海洋污染的威胁。苯并芘(BaP)是一种全球分布的海洋环境污染物，对海洋生态系统构成重要威胁。然而，珊瑚共生体对全球海洋污染物的胁迫反应仍不清晰。本研究以美丽鹿角珊瑚(Acropora formosa)为对象，使用4D-DIA定量蛋白质组学和16s来探索其对BaP应激的反应。研究结果从蛋白水平揭示了珊瑚应答BaP胁迫的毒理机制，同时为保护珊瑚礁生态系统的保护和修复提供重要依据。
▶ 研究结果
不同比较组中珊瑚和虫黄藻的蛋白图谱展示
