
2025年4月,nature metabolism重磅发声:代谢物不是基因——警惕代谢组中通路分析的错误使用!
在生命科学迈入“多组学时代"的今天,代谢组学因其贴近生理状态、精准描绘表型变化而备受关注。尤其在疾病机制解析、临床转化、生物标志物发现、新药筛选、微生态研究等领域,代谢组学正逐渐成为不可或缺的研究工具。
其中代谢通路分析,是代谢组学数据解读的“黄金步骤”,是连接代谢物变化与生物机制的核心桥梁——但我们始终需警惕一个灵魂拷问:代谢物浓度升高,是否能代表整个通路被激活?富集显著的通路,真的“被调控”了吗?

nature metabolism文章指出,直接将“富集P值+通路显著性”照搬到代谢组,是非常危险的行为,可能会得出误导性结论或掩盖真实机制。
代谢物是通路的“结果”,不一定反映因果。它的升高有可能是下游阻断、也可能是运输障碍。例如乳酸升高并不等同于糖酵解增强,实际上可能是线粒体功能受损,丙酮酸无法进入TCA循环,被迫转化为乳酸。
所以研究者建议代谢组学研究应该从“浓度”向“通量”过渡,建议发展代谢流分析(metabolic flux analysis)、同位素示踪等方法观察通路真实走向,而非仅凭浓度猜测。
深耕科研赋能,解锁代谢真相!百趣生物重磅升级靶标代谢流检测分析技术,由30+物质的检测列表提升至140+物质的检测列表,覆盖糖酵解(EMP)、TCA循环、磷酸戊糖途径(PPP)、核苷酸代谢等多条代谢途径,可全面研究临床、动物、植物样本中代谢通量随时间变化的动态规律,准确分析流经代谢途径的代谢流量,清晰阐释代谢物在代谢途径中的变化机制,进而将代谢组学研究提升到更高水平。

技术优势
实现同位素追踪
基于13C标记的碳代谢流分析
基于15N标记的氮代谢流分析
能量代谢通路覆盖广
一次性可检测140+与能量代谢相关物质
涵盖糖酵解、TCA循环、PPP三条中心碳代谢通路
包括氨基酸代谢、核苷酸代谢、嘌呤代谢、嘧啶代谢等多条能量代谢相关通路
应用方向
靶标代谢流Pro可以广泛应用于生命科学和生物医药领域,具体包括疾病诊断、预后评估、药物临床研究、植物色泽品质、植物非生物胁迫等研究方向。
基因工程
提高基因工程菌目标代谢产物的产量;研究基因改造前后的代谢功能变化。
疾病机理
揭示肿瘤代谢抑制剂个性化治疗机制;发现疾病发生发展过程早期诊断的标志物。
代谢重编程
研究炎症性巨噬细胞免疫代谢重编程机制;探索植物叶绿体代谢重编程机制。
样本建议量
细胞: 1×10⁷ cells/sample
类器官:100 mg/sample
组织: 100 mg/sample
液体: 200 μL/sample
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参考文献
Lee KS, Su X, Huan T. Metabolites are not genes - avoiding the misuse of pathway analysis in metabolomics. Nat Metab. 2025 May;7(5):858-861. doi: 10.1038/s42255-025-01283-0IF: 20.8 Q1 . PMID: 40211046.