真核无参转录组
真核无参转录组测序是针对没有参考基因组或缺乏高质量参考基因组的真核生物（如部分未完成基因组测序的动植物、珍稀物种或特定菌株等）通过高通量测序（RNA-seq）进行mRNA研究的技术，无需依赖参考基因组，直接进行转录本组装和分析的技术手段。它通过构建转录本数据库，实现基因表达定量、差异分析及功能分析等研究目标。
技术优势
1、适用性广：无需依赖参考基因组，可对未完成测序的物种或基因组组装质量差的物种进行转录组研究，拓展了转录组学的应用范围。
2、发现新基因：能直接捕获物种特有的转录本或新基因，尤其适用于研究进化地位特殊或未被充分研究的物种。
3、低成本：避免了基因组测序的高昂成本，对于资源有限的研究对象更具可行性。
应用方向
1、非模式生物研究：对珍稀动植物、濒危物种或小众实验材料进行基因表达分析，揭示其独特的生物学特性（如极端环境适应性、特殊代谢途径）。
2、基因组资源匮乏物种的初步探索：为后续基因组测序提供基础数据（如基因序列、标记信息），或直接用于功能基因挖掘。
3、群体遗传学研究：通过转录组SNP标记分析种群遗传结构、适应性进化等（如不同地理种群的基因表达差异）。
4、快速筛选候选基因：在缺乏参考基因组的物种中，快速鉴定与表型相关的差异表达基因（如作物的抗病性、果实品质相关基因）。
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